PCR實驗室在空間布局上分為試劑準(zhǔn)備區(qū)、樣品制備區(qū)、擴(kuò)增區(qū)和擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)四個單獨(dú)的工作區(qū)域，并設(shè)有專用走廊，以及緩沖區(qū)。

PCR實驗室的裝修，墻壁、頂板和地板應(yīng)光滑、易清潔、防滲漏并耐化學(xué)品和消毒劑的腐蝕。不得在實驗室內(nèi)鋪設(shè)地毯和窗簾。地面采用PVC塑膠地板，墻體圍固要?dú)饷苄粤己?，墻體、天花板、地面所有的陰角、陽角都需要圓弧處理。

PCR實驗室凈高宜為2.5米-2.7米，走廊凈寬宜為2.5米-3.0米。PCR實驗室安裝凈化門，自帶閉門器，采用傳遞視窗，保證氣密性，以防外界污染物的進(jìn)入。

為避免各個實驗區(qū)域交叉污染的可能性，采用全送全排的氣流組織形式，嚴(yán)格控制送、排風(fēng)的比例以保證各實驗區(qū)壓力要求。實驗室的氣流應(yīng)從擴(kuò)增前區(qū)流向擴(kuò)增后區(qū)，不得逆向流動。實驗室應(yīng)選用凈化燈具，保障電力供應(yīng)，同時應(yīng)設(shè)應(yīng)急照明裝置。

實驗臺柜和座椅采用穩(wěn)固的全鋼實驗臺，邊角圓滑處理，柜門抽屜帶阻尼，三段式自動閉合，臺面采用防水、耐熱、耐有機(jī)溶劑、酸堿、消毒劑的實芯理化板或者環(huán)氧樹脂板。

此外，PCR實驗室內(nèi)每個房間的所有進(jìn)、出風(fēng)口均需加裝相應(yīng)的設(shè)備或裝置。具體的裝修建設(shè)規(guī)范則需要根據(jù)使用場景以及當(dāng)?shù)氐囊?guī)范，而有所不同。